A paraziták befolyásolják gazdasejtük populációját a

a paraziták befolyásolják gazdasejtük populációját a

Nukleo-citoplazmatikus nagy DNS-vírusok feltárása a tara óceánok mikrobiális metagenomáiban az isme napló témák Mikrobiális biooeanográfia Absztrakt A nukleo-citoplazmatikus nagy DNS-vírusok NCLDV-k eukarióta vírusok csoportját alkotják, amelyek döntő ökológiai szerepet játszhatnak a tengerben az egysejtű gazdasejtük gyorsulásának felgyorsítása vagy az állatok betegségeinek kiváltása révén.

A tengeri NCLDV-k sokszínűségének, bőségének és biogeográfiájának jobb jellemzése érdekében 17 metagenomát elemeztünk a Tara-óceánok expedíciója során gyűjtött mikrobiális mintákból 0, 2—1, 6 μm mérettartományban. A mintakészlet olyan ökoszisztémákat foglal magában, amelyekben a korábbi tanulmányok alulreprezentáltak, mint például az Arab-tengeri oxigén minimum zóna OMZ és az Indiai-óceán lagúnái. Taxon-együttes előfordulási elemzésünk potenciális kapcsolatot mutatott ki a Megaviridae család a paraziták befolyásolják gazdasejtük populációját a és az oomicitákhoz kapcsolódó eukariótok között.

A várható asszociáció alátámasztására hat esetet azonosítottunk a Megaviridae és az oomycetes közötti laterális génátvitelről. Eredményeink azt sugallják, hogy a tengeri NCLDV-k valószínűleg meghaladják az eukarióta organizmusok számát a fototikus rétegben egy adott víztömegre vonatkoztatvaés hogy a metagenomikus szekvenciaelemzések új fényt adnak a tengeri vírusok biológiai sokféleségére és a potenciális gazdaszervezettel való kölcsönhatásukra.

Bevezetés Úgy gondolják, a paraziták befolyásolják gazdasejtük populációját a a vírusok rendkívül bőségesek a tengerben. Valójában a fágok önmagukban meghaladják a tengervíz összes többi életformáját, tükrözve a baktérium-gazdagok bőségét Suttle, Kevés azonban a más sejtes organizmusokat, különösen az eukariótokat fertőző tengeri vírusok sokféleségéről, bőségéről és biogeográfiájáról. Bár az eukarióták kevésbé számítanak, mint a baktériumok, az eukarióták gyakran képviselik a plankton biomassza nagy részét, és közvetítik a fontos biogeokémiai és táplálkozási folyamatokat Falkowski és mtsai.

Gazdasejtjeik rendkívül széles taxonómiai spektrumot mutatnak, mikroszkopikus egysejtű eukariótáktól a nagyobb állatokig, beleértve az embereket is. Például a Heterosigma akashiwo vírus HaV befolyásolja az egysejtű algás gazdaszervezet populációdinamikáját, amely szezonálisan káros virágokat képez a tengerparti területeken Tomaru et al.

Egy másik jól ismert vírus Emiliania huxleyi vírusok EhV a mindenütt jelen levő haptophyte E. Az NCLDV-kbe beletartoznak a nagyon nagy virionrészecskékkel rendelkező vírusok, amelyek nem haladnak át a vírusmetagenomikában általában alkalmazott 0, 2 μm-es szűrőkön a vírusok más szervezetektől történő elkülönítésére Van Etten, A paraziták befolyásolják gazdasejtük populációját a ilyen nagy vírusok prototípusa, amelyet girusoknak is neveznek Claverie és mtsai.

Ez számos fogalmi áttörést eredményezett a vírusok eredetének és a sejtes organizmusok fejlődéséhez fűződő kapcsolatának megértésében Claverie, ; Forterre, ; Raoult és Forterre, ; Forterre, ; Legendre et al. A Mimivirus genom szekvenálása számos közeli homológ felfedezését váltotta ki a környezeti szekvenciaadatokban Lopez-Bueno és mtsai.

Eloskodok az emberi testben.

Nem sokkal később két óriási, a Mimivírussal kapcsolatos vírust izoláltak a tengeri környezetből. Ezek a Cafeteria roenbergensis vírus CroV; kbamely egy fő tengeri mikroflagéllátos grazert Fischer et al. A szekvencia-adatok és az elemzések közelmúltbeli felhalmozódásának köszönhetően az NCLDV filogenetikai fa látható része gyorsan bővül, és az NCLDV tengeri jelenlétét egyre inkább felismerik. Biológiájukkal kapcsolatos ismereteink azonban továbbra is korlátozottak, így meg kell határozni az olyan alapvető ökológiai paramétereket, mint a bőség és a gazdaszervezet rendszertani tartománya.

A legkisebb szabadon élő zöld alga O.

detox hívások fizetni személyes számla belépés hogy néznek ki a kerekférgek az emberben

Az EhV-k előfordulása több mint7—1 vírus elérheti a gyorsan növekvő gazdaszervezetben a gazdavirágzást szimuláló mezokozmikus kísérletekben Schroeder et al. Jelenleg nem áll rendelkezésre közvetlen módszer a különféle NCLDV-k mennyiségének felmérésére egy komplex mikrobiális együttesben, amelyben túlnyomó részben baktériumsejtek és fágok dominálnak.

A tengeri NCLDV-k sokszínűségének és földrajzi eloszlásának jobb megértése érdekében elemeztük a Tara Oceans által létrehozott metagenomikus szekvenciaadatok egy részhalmazát 0, 2—1, 6 μm-es frakcióegy nemzetközi féreg elleni gyógyszerek felnőttek számára tudományos programban, amelynek célja az óceán plankton sokféleségének jellemzése, ezen sodródás szerepe mikroorganizmusok a tengeri ökoszisztémákban és reagálásuk a paraziták befolyásolják gazdasejtük populációját a környezeti változásokra Karsenti et al.

A mintákat a gibraltári szoroson, a Földközi-tengeren és a Vörös-tengeren keresztül az Indiai-óceán közepéig tartó expedíció első évében gyűjtötték 1. A korábbi metagenomiás vizsgálatokban alulreprezentált tengeri régiók, mint például az Arab-tengeri oxigén minimális övezet OMZ és az Indiai-óceán lagúnái, bele vannak foglalva a mintába. A legtöbb prokarióta sejt és sok nagy vírusrészecske várhatóan befogódik a jelen metagenóma vizsgálatban alkalmazott 0, 2—1, 6 μm méretű frakcióba.

Itt megmutatjuk, hogy a a paraziták befolyásolják gazdasejtük populációját a NCLDV szekvenciák lényegesen különböznek az ismert referencia-genomoktól, ami az óriás tengeri vírusok nagyfokú változatosságára utal. Az NCLDV genomok koncentrációját a mintákban úgy becsültük meg, hogy a metagenóma-adatot az FC-vel meghatározott prokarióta-bőséggel és mikroszkópos módszerrel faktoráltuk a Tara-on egyidejűleg gyűjtött mintákon.

Végül teszteltük az adatkészletünkben található taxonok együttes előfordulási mintázatainak képességét Chaffron et al. Teljes méretű tábla Eredmények A metagenomák általános jellemzői A vizsgálatban szereplő mintákat a Tara-óceán expedíciójának részeként gyűjtöttük A vizsgált 17 mikrobiális minta a 13 mintavételi helyről származik, és a méretaránynak felel meg 0, 2 és 1, 6 μm között 1.

Ezeket a mintákat úgy választottuk meg, hogy a biomák széles skáláját képviselik.

Férgek keringese

Rusch és munkatársai, Ezek képezik a tanulmányban elemzett legfontosabb adatkészletet. Ezeket a markereket általában genomjában egyetlen példány génként kódolják, ezért a metagenomák bősége tükrözi a haploid genomok számát a szekvenált mintákban.

Tizenhét TOP metagenomot 0, 2—1, 6 μm méretű frakció egyesítettünk és egyetlen adatkészletként a paraziták befolyásolják gazdasejtük populációját a a diagram készítéséhez.

  1. A paraziták befolyásolják gazdasejtük populációját a - Milyen paraziták elhetnek egy emberben
  2. Szivféreg larva

A grafikon minden pontja jelöli az egyik marker gén sűrűségét, amelyet ebben a vizsgálatban használtak 16 marker az NCLDV-k számára és 35 marker a sejtgenomokhoz. A Tara fedélzetén gyűjtött vízminták prokarióta sejt-eloszlását és mikroszkópos vizsgálatát a metagenom mintákkal egyidőben végeztük, hogy a relatív NCLDV genom bőséget abszolút koncentrációkba méretezzük. A mintavétel során nem figyeltünk meg algavirágzást, és ezek az intézkedések az óceánok prokarióta sejtsűrűségének tipikus tartományaiba esnek Suttle, Teljes méretű kép A homológ szekvenciák kimutatása egy marker génnel számos tényezőtől függ, mint például a megőrzési szint és a génhossz, valamint a vizsgált metagenomok taxonómiai összetétele.

Feltételeztük, hogy több, nagymértékben eltérő enzimatikus funkcióval rendelkező gén használata növeli az eljárás általános pontosságát. A lehetséges műtermékek hatásának becsléséhez megismételjük a fenti számításokat, miután hozzáadtuk a marker gén méretének normalizálását.

Ugyanezen mintavételi helyeken a 7. Az egyes víruscsoportokhoz taxonómiailag hozzárendelt markerek száma a jelmagyarázatban zárójelben látható.

RÁD TELEPSZENEK! - Élősködők kritika mango férgek

Az a és a b pontban három, az Asfarviridae és Poxviridae hozzá rendelt olvasmányokat kihagytak a bemutatás céljából. Teljes méretű kép A PolB filogenetikai térképezési elemzéssel végzett független osztályozás a leolvasások globálisan hasonló taxonómiai eloszlását mutatta a különféle NCLDV vonalok között 4.

A Phycodnaviridae és Megaviridae családok számára rendelkezésre álló referenciagenom szekvenciák közelmúltbeli bővítésének köszönhetően a prasinovírusok egyértelműen felismerhetők a tengeri phycodnavírusok leggyakoribb csoportjaként.

Az utóbbi vírusok gazdasejtjei széles körben elterjedtek az eukarióták osztályozásában: C.

a paraziták befolyásolják gazdasejtük populációját a

Érdekes módon sok metagenomikus leolvasást viszonylag mély ágakhoz rendeltünk. Összességében ezek az eredmények azt sugallják, hogy a TOP mintákban képviselt NCLDV-k többsége nagyon különféle és csak távoli kapcsolatban áll az ismert vírusokkal, így potenciálisan megfelel a különböző tengeri eukariótokat fertőző vírusoknak. E peptideket mindegyik egy nagy referencia filogenetikai fába helyeztük, amely különféle vírusos és sejtes homológokat tartalmaz Kiegészítő S1 ábra Pplacer alkalmazásával.

Ezekből a peptidekből et leképeztek az NCLDV-szekvenciákhoz vezető ágakon, és ezeket az ábra szemlélteti. A leképezett metagenomikus leolvasások száma az teniosis okozta jelenik meg, és az ágszélesség tükrözi.

Ez az eredmény megegyezik a Phycodnaviridae és a Megaviridae családok túlnyomó többségével, amelyet a BLAST-alapú markergén-elemzésünkben tapasztaltunk. Teljes méretű kép A MutS fehérje alcsaládok összefüggése a Megaviridae előfordulásával A MutS DNS nem egyezőségét javító fehérje két nemrégiben azonosított alcsaládja nagy vírusú halmazra specifikus Ogata et al.

A lehetséges Megaviridae eredetű szekvenciáknak a TOP adatkészletben megfigyelt magas előfordulása ösztönözte adatainkat a MutS7 és a MutS8 homológokra. Ha ezek a MutS gének a feltételezett Megaviridae vírusokból származnak, amelyeket a markergén módszerünkkel detektáltunk, akkor számíthatunk korrelációra a minták közötti bőségükben. Ez az eredmény azt sugallja, hogy a Megaviridae családhoz rendelt TOP olvasmányok valószínűleg olyan nagy vírusú vírusokból származnak, amelyek a család ismert vírusaiban megtalálhatók.

Balázs gazda - Nyüvek, légy lárvák eltávolítása (Maggots removal)

Ez összesen potenciális taxon-asszociációs párt azonosított, amelyek közül et mindkét módszer támasztotta alá S3. Kiegészítő táblázat. A két lista közötti eltérés a második módszer magasabb szigorúságának, valamint a sajátos fotográfiai-OMZ-ellentéteknek köszönhető, amelyeket csak az első módszer vett figyelembe.

Ez megmagyarázható a hasonló organizmusok taxonómiai hozzárendelésével rokon, de különálló taxonómiai csomópontokhoz az NCBI taxonómia adatbázisában.

parazita az emberi testben

Elemzésünk azonban a vonalak ismert biológiai társulásait is felfedte. Úgy tűnik, hogy ez utóbbi egyszerűen csak az egymást átfedő tartózkodási vizeket tükrözi. Ezek az ismert asszociációs példák kontrollként a féreg a gyermekben fehér, amelyek arra utalnak, hogy a következtetett hálózat hasznos lehet a bányászatban a plankton organizmusok feltételezett új társulásainak vagy szegregációinak.

Laposférgek | A biológia alapjai tanító- és óvóképzős hallgatók számára

A vírus és a sejtes organizmusok előfordulása közötti pozitív és a paraziták befolyásolják gazdasejtük populációját a összefüggések példáit a 3. Néhány taxonpárra nincs egyszerű magyarázat, például a vírus-sejt kölcsönös kizárásokra, valamint az eukarióta vírusok egyes baktériumokkal való társulására bár ez utóbbi oka lehet a HGT által egy vírusgenomban megszerzett baktériumgéneknek köszönhetően.

Közötti kapcsolat azonban felhívta a figyelmünket, mivel ez nem felel meg az ismert vírus-gazda kapcsolatnak. A taxonómiai feladataik viszonylag magas rangsorával összhangban a Megaviridae és az oomycetes csomópontok leolvasása kimutatta, hogy nagy eltérést mutatnak a referenciafehérje-szekvenciáktól. Teljes méretű tábla Az együttes előfordulás elemzéséből következtetni lehet a taxon-asszociációkra.

Kis féreg fajok

A hisztogram színes piros és zöld területei taxonpárokat mutatnak, statisztikailag szignifikáns korrelációt mutatva. Mindegyik pont megfelel a vizsgált 17 legfontosabb minta egyikének. Teljes méretű kép A jobb taxonómiai felbontás érdekében az oomycete taxonómiai csomóponthoz rendelt 19 leírás filogenetikai elemzését végeztük. Kiegészítő ábra 1 - S A fennmaradó hét olvasatban filogenetikai helyzetük meglehetősen gyenge volt és nem mutattak koherens kapcsolatot az egyes taxonómiai csoportokkal S — S kiegészítő ábrák.

a paraziták befolyásolják gazdasejtük populációját a férgek kezelésére szolgáló program

A Megaviridae csomóponthoz rendelt 31 lelet D5 családfehérjék hasonló elemzése a legtöbb esetben megerősítette a kezdeti taxonómiai megjegyzésüket kiegészítő S8. Ábranéhányat a víruscsalád gyökeréhez közel helyezve.

Olvassa el is